Foi em 11 de novembro de 1871 que os moradores do bairro ganharam oficialmente sua estação, inaugurada para atender ao embarque e desembarque dos operários que trabalhavam na construção das oficinas do Engenho de Dentro. Esta foi idealizada para abrigar o serviço de manutenção dos trens.

Terra de Catulo da Paixão Cearense, Orlando Silva, Sílvio Caldas e Domingos da Guia, limitado pelo Méier, Encantado, Água Santa e Todos os Santos, O Engenho de Dentro desenvolveu-se assim como uma região industrial. Mas foi com a construção da estação de trem que a história do subúrbio carioca, começou a ganhar aspectos bastante relevantes.

Desde 1858 a área já era usada como parada para os trens que circulavam no primeiro trecho da Estrada Férrea Pedro II --surgida oficialmente 14 anos depois. Na época as composições partiam da Central do Brasil e tinham o Engenho de Dentro e Cascadura como estações intermediárias, antes de chegarem ao ponto final, em Queimados.

Em várias ocasiões, o Imperador D.Pedro 2° visitou a estação e as oficinas, em suas frequentes inspeções às obras de construção da ferrovia. Por muitos anos, a Estação do Engenho de Dentro funcionou com poucos empregados. Um ajudante de contador, um telegrafista, um auxiliar e dois guarda-chaves eram os responsáveis pelos serviços de cancelas e bagagens.

De acordo com as pesquisas realizadas pelo Programa de Preservação histórico do ministério dos transportes, já em 1869 o então diretor da estrada de ferro, Mariano Procópio Ferreira Lage, registrava um grande movimento de trens pela região, variando entre 20 e 30 por dia.

Com o gradativo aumento do volume de passageiros, o prédio original foi demolido e um novo construído no mesmo local.

No dia 13/07 a estação foi entregue totalmente modernizada. Reforma do mezanino, agora com acessibilidade plena e construção de um novo, ampliação da capacidade para receber até 26 mil passageiros por dia, instalação de cinco elevadores, rampas de acesso, nivelamento das plataformas, reforma dos banheiros e modernização da iluminação.

O telhado, tombado pelo IRPH também passou por reformas, obedecendo aos critérios de restauração estabelecidos pelo órgão. A estação atende principalmente ao público que vai ao Estádio Olímpico João Havelange, SESC, Supermercado Guanabara, Hospital Memorial, Praça do Trem e aos eventos do Food Park in Rio e Samba da Feira, além de proporcionar a união com os ramais Deodoro, Santa Cruz e Japeri.